Слово «рунет» стало именем нарицательным, а нарицательные существительные пишем со строчной.

Еще «рунет» склоняется по падежам:

и. рунет
р. рунета
д. рунету
в. рунет
т. рунетом
п. о рунете

Писать «рунет» с большой буквы в 2016-м, это как писать «интернет» с большой буквы в 2014-м. Пережиток прошлого.

Все больше изданий пишут правильно.

Запомним: рунет — с маленькой